Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME3Q16798 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME3Q16798 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ME3Q16798 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME3Q16798 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME3Q16798 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ME3Q16798 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME3Q16798 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME3Q16798 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME3Q16798 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME3Q16798 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ME3Q16798 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ME3Q16798 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ME3Q16798 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ME3Q16798 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ME3Q16798 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ME3Q16798 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ME3Q16798 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ME3Q16798 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ME3Q16798 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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