Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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SS18Q15532 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SS18Q15532 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SS18Q15532 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SS18Q15532 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SS18Q15532 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SS18Q15532 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SS18Q15532 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SS18Q15532 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SS18Q15532 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SS18Q15532 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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