Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RAB35Q15286 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB35Q15286 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms