Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL19A1Q14993 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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COL19A1Q14993 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COL19A1Q14993 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COL19A1Q14993 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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