Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MADCAM1Q13477 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms