Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 SFI1YLL003W 2841 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YJL206CYJL206C 2277 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 GIP4YAL031C 2283 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 URK1YNR012W 1506 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YHR182WYHR182W 2358 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 PHO13YDL236W 939 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 PET100YDR079W 336 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 RGI1YER067W 486 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 NDL1YLR254C 570 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 VPS20YMR077C 666 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YOR365CYOR365C 2112 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 LOA1YPR139C 903 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 MSC2YDR205W 2175 nt5.25□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YEH2YLR020C 1617 nt5.24□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 ARG82YDR173C 1068 nt5.24□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 BSC2YDR275W 708 nt5.24□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 PRP38YGR075C 729 nt5.24□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 COA3YJL062W-A 258 nt5.24□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YOR238WYOR238W 912 nt5.24□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 AKL1YBR059C 3327 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 SYF1YDR416W 2580 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 PAN1YIR006C 4443 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 PDR15YDR406W 4590 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 TSC13YDL015C 933 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 FMP33YJL161W 543 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 UBI4YLL039C 1146 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 PFK27YOL136C 1194 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 TMC1YOR052C 453 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 SME1YOR159C 285 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YBR053CYBR053C 1077 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YBR063CYBR063C 1215 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YCL007CYCL007C 393 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 GAD1YMR250W 1758 nt5.23□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 SEG2YKL105C 3399 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 CUE3YGL110C 1875 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 MDM30YLR368W 1797 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 SHE9YDR393W 1371 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YDR535CYDR535C 501 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 ERV29YGR284C 933 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 KTR2YKR061W 1278 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 VMA6YLR447C 1038 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 CIN2YPL241C 807 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 HPA2YPR193C 471 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 TDA6YPR157W 1404 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 VPS38YLR360W 1320 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 MSS4YDR208W 2340 nt5.22□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 MNT2YGL257C 1677 nt5.21□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 UGA3YDL170W 1587 nt5.21□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 SPH1YLR313C 1593 nt5.21□□□□□ -1.57
SSF2Q12153 YDR355CYDR355C 303 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 WBP1YEL002C 1293 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 GLG2YJL137C 1143 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 AUR1YKL004W 1206 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 PSF3YOL146W 585 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 FIG1YBR040W 897 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 snR37snR37 386 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 NTH1YDR001C 2256 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 TPD3YAL016W 1908 nt5.21□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 CRT10YOL063C 2874 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 HNT2YDR305C 654 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 IRC22YEL001C 678 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YGR026WYGR026W 837 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YGR115CYGR115C 780 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 ATG38YLR211C 681 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 MCM16YPR046W 546 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 REI1YBR267W 1182 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 KRE6YPR159W 2163 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 IDS2YJL146W 1410 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 AXL2YIL140W 2472 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 SSH4YKL124W 1740 nt5.2□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 UBX5YDR330W 1503 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 GUK1YDR454C 564 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YJR012CYJR012C 624 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YKL131WYKL131W 522 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 NIS1YNL078W 1224 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YNR071CYNR071C 1029 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 PEP4YPL154C 1218 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 NMD3YHR170W 1557 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 DAL81YIR023W 2913 nt5.19□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 ADP1YCR011C 3150 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 PTR3YFR029W 2037 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 MPS3YJL019W 2049 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 HOM3YER052C 1584 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 RPS25AYGR027C 327 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 MRP4YHL004W 1185 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 IKI1YHR187W 930 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YIL165CYIL165C 360 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YNK1YKL067W 462 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YAR030CYAR030C 342 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 SPR2YOR214C 711 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 ALR2YFL050C 2577 nt5.18□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 AIM14YGL160W 1713 nt5.17□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 DPH6YLR143W 2058 nt5.17□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 NAM2YLR382C 2685 nt5.17□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 YDR203WYDR203W 318 nt5.17□□□□□ -1.58
SSF2Q12153 APA2YDR530C 978 nt5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms