Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POU5F1Q01860 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POU5F1Q01860 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms