Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RUNX1Q01196 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX1Q01196 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms