Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAGEA4P43358 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MAGEA4P43358 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms