Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RPS11BYBR048W 471 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 ECM8YBR076W 1065 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 GRX1YCL035C 333 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 SEC6YIL068C 2418 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 NEM1YHR004C 1341 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 TRM1YDR120C 1713 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PDR12YPL058C 4536 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PIM1YBL022C 3402 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 SRO7YPR032W 3102 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YPS7YDR349C 1791 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 BUD16YEL029C 939 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 HIS5YIL116W 1158 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 MRPL49YJL096W 486 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 ATP12YJL180C 978 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 GPI1YGR216C 1830 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 BUD27YFL023W 2391 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 ACA1YER045C 1470 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 DBP3YGL078C 1572 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 ATG2YNL242W 4779 nt3.85□□□□□ -1.79
SEC28P40509 AEP3YPL005W 1821 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 SLM2YNL047C 1971 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 FAT1YBR041W 2010 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PCL2YDL127W 927 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 BSC2YDR275W 708 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 POP6YGR030C 477 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 MRPL6YHR147C 645 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 SPO20YMR017W 1194 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 GLO4YOR040W 858 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 USV1YPL230W 1176 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 SPT16YGL207W 3108 nt3.84□□□□□ -1.79
SEC28P40509 MIC60YKR016W 1623 nt3.84□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YOL019WYOL019W 1656 nt3.84□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MTC4YBR255W 2085 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MAG1YER142C 891 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 ERJ5YFR041C 888 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 PDX1YGR193C 1233 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 IRC9YJL142C 393 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 IRC25YLR021W 540 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 NIT3YLR351C 876 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 REH1YLR387C 1299 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MED11YMR112C 396 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MRPS9YBR146W 837 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 FAR8YMR029C 1572 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 CLN2YPL256C 1638 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 CTM1YHR109W 1758 nt3.83□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MNL1YHR204W 2391 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 SEC59YMR013C 1560 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 GYP6YJL044C 1377 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 ADH4YGL256W 1149 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 RPB3YIL021W 957 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 DID4YKL002W 699 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MYO3YKL129C 3819 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YLR444CYLR444C 303 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YOR342CYOR342C 960 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 GPI2YPL076W 843 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 RIB5YBR256C 717 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 ISM1YPL040C 3009 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 MLH2YLR035C 2088 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 TCB3YML072C 4638 nt3.82□□□□□ -1.8
SEC28P40509 RPO31YOR116C 4383 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 PHO5YBR093C 1404 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 TRM12YML005W 1389 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YPR148CYPR148C 1308 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 BIK1YCL029C 1323 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 RRP8YDR083W 1179 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 DDI2YFL061W 678 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YKE4YIL023C 1041 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 RRG9YNL213C 645 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 DDI3YNL335W 678 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YOR263CYOR263C 408 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 DIB1YPR082C 432 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 SCD6YPR129W 1050 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 NTH1YDR001C 2256 nt3.81□□□□□ -1.8
SEC28P40509 REB1YBR049C 2433 nt3.8□□□□□ -1.8
SEC28P40509 PDS1YDR113C 1122 nt3.8□□□□□ -1.8
SEC28P40509 HOM2YDR158W 1098 nt3.8□□□□□ -1.8
SEC28P40509 UBC8YEL012W 657 nt3.8□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YBL096CYBL096C 309 nt3.8□□□□□ -1.8
SEC28P40509 CAF20YOR276W 486 nt3.8□□□□□ -1.8
SEC28P40509 CAF130YGR134W 3369 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YDR355CYDR355C 303 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 FUR1YHR128W 651 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 ERG5YMR015C 1617 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 RPB2YOR151C 3675 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 NOG1YPL093W 1944 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 SYT1YPR095C 3681 nt3.79□□□□□ -1.8
SEC28P40509 ABP140YOR239W 1887 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YCR015CYCR015C 954 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YGR051CYGR051C 324 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 TFA2YKR062W 987 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 TEX1YNL253W 1269 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 GAL11YOL051W 3246 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 UBX5YDR330W 1503 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 FMP25YLR077W 1752 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 YPL109CYPL109C 1974 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 TED1YIL039W 1422 nt3.78□□□□□ -1.8
SEC28P40509 LCB5YLR260W 2064 nt3.77□□□□□ -1.81
SEC28P40509 YDL186WYDL186W 834 nt3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.5 ms