Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITGAEP38570 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
ITGAEP38570 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITGAEP38570 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms