Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	DCS1	YLR270W	1053 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YBR053C	YBR053C	1077 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	POC4	YPL144W	447 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	TYR1	YBR166C	1359 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.45	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	CUS1	YMR240C	1311 nt		3.44	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	NOP6	YDL213C	678 nt		3.44	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	FMC1	YIL098C	468 nt		3.44	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	IES3	YLR052W	753 nt		3.44	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	MRPL51	YPR100W	423 nt		3.44	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YNR063W	YNR063W	1824 nt		3.44	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YOL019W	YOL019W	1656 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	GCD7	YLR291C	1146 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	CPR3	YML078W	549 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	AIM41	YOR215C	558 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	CNS1	YBR155W	1158 nt		3.43	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SMP3	YOR149C	1551 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	MPC54	YOR177C	1395 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YIL086C	YIL086C	309 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	THR4	YCR053W	1545 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	TAF8	YML114C	1533 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	CTR86	YCR054C	1692 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SPB4	YFL002C	1821 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	GEM1	YAL048C	1989 nt		3.42	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	VPS45	YGL095C	1734 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	MAF1	YDR005C	1188 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	ERG26	YGL001C	1050 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	ARD1	YHR013C	717 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	REE1	YJL217W	597 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SPC3	YLR066W	555 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YLR428C	YLR428C	345 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	PRX1	YBL064C	786 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SUI3	YPL237W	858 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SAS4	YDR181C	1446 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.41	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	KRI1	YNL308C	1776 nt		3.4	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	EXO5	YBR163W	1758 nt		3.4	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	GZF3	YJL110C	1656 nt		3.4	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	GAT2	YMR136W	1683 nt		3.4	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.4	□□□□□ -1.86
ATG12	P38316	RPS13	YDR064W	456 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	LSM6	YDR378C	261 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	ERJ5	YFR041C	888 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YHR180W	YHR180W	492 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YOL050C	YOL050C	321 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	FRM2	YCL026C-A	582 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YLR446W	YLR446W	1302 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SRO9	YCL037C	1305 nt		3.4	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RSC3	YDR303C	2658 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	POL1	YNL102W	4407 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	DIN7	YDR263C	1293 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	FCF1	YDR339C	570 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RIM4	YHL024W	2142 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	TTI2	YJR136C	1266 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YKL177W	YKL177W	339 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	HTA2	YBL003C	399 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	MNR2	YKL064W	2910 nt		3.39	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	DSF2	YBR007C	2211 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YCL068C	YCL068C	783 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YCR101C	YCR101C	549 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	FAP7	YDL166C	594 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	COX23	YHR116W	456 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RSM25	YIL093C	795 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SFH5	YJL145W	885 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	AHP1	YLR109W	531 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RAD33	YML011C	534 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	VPS21	YOR089C	633 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	SHE3	YBR130C	1278 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	NAT1	YDL040C	2565 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.38	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	VPS27	YNR006W	1869 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	POL31	YJR006W	1464 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	TRP4	YDR354W	1143 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	RTA1	YGR213C	954 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YHL026C	YHL026C	948 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	COS8	YHL048W	1146 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YHI9	YHR029C	885 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YJL028W	YJL028W	336 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	YML053C	YML053C	639 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	VID27	YNL212W	2349 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	PMS1	YNL082W	2622 nt		3.37	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	GPI1	YGR216C	1830 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	snR57	snR57	88 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	NUS1	YDL193W	1128 nt		3.36	□□□□□ -1.87
ATG12	P38316	CLC1	YGR167W	702 nt		3.36	□□□□□ -1.87

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