Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00271P0C7V0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms