Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C6orf47O95873 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C6orf47O95873 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms