Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNCRIPO60506 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCRIPO60506 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCRIPO60506 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms