Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms