Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPG2Q9UBF2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPG2Q9UBF2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms