Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK12Q9NYV4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDK12Q9NYV4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK12Q9NYV4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms