Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPS25Q9BRG1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPS25Q9BRG1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms