Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
UBE2E2Q96LR5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBE2E2Q96LR5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms