Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTD1Q8N815 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTD1Q8N815 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms