Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS3Q8IXF0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS3Q8IXF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS3Q8IXF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms