Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLF9Q13886 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLF9Q13886 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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