Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MADCAM1Q13477 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MADCAM1Q13477 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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