Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP11P51784 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP11P51784 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP11P51784 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP11P51784 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP11P51784 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP11P51784 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP11P51784 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP11P51784 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP11P51784 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP11P51784 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP11P51784 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP11P51784 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms