Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GARSP41250 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GARSP41250 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GARSP41250 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GARSP41250 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GARSP41250 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GARSP41250 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GARSP41250 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GARSP41250 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GARSP41250 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GARSP41250 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms