Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 DPB4YDR121W 591 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YDR222WYDR222W 1248 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 SIL1YOL031C 1266 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 RFM1YOR279C 933 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 UAF30YOR295W 687 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 DHR2YKL078W 2208 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 RIM4YHL024W 2142 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 ULP1YPL020C 1866 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 ERB1YMR049C 2424 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 NOC2YOR206W 2133 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YCF1YDR135C 4548 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 ALG1YBR110W 1350 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 PRP11YDL043C 801 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YHL045WYHL045W 348 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YIL025CYIL025C 375 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 CAB2YIL083C 1098 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 BLS1YLR408C 369 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 DSL1YNL258C 2265 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 DSN1YIR010W 1731 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 IOC2YLR095C 2439 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 HAP4YKL109W 1665 nt3.94□□□□□ -1.78
SEC28P40509 SRP72YPL210C 1923 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 NRP1YDL167C 2160 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 GPI10YGL142C 1851 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YOS1YER074W-A 258 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YER076CYER076C 909 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 POG1YIL122W 1056 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 PNT1YOR266W 1272 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YBR242WYBR242W 717 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 SMI1YGR229C 1518 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 IMD4YML056C 1575 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 DAP2YHR028C 2457 nt3.93□□□□□ -1.78
SEC28P40509 TRE2YOR256C 2430 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 HSP30YCR021C 999 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YDL241WYDL241W 372 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YBL036CYBL036C 774 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 MRPS17YMR188C 714 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YOL024WYOL024W 519 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 IAH1YOR126C 717 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 POS5YPL188W 1245 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 SER3YER081W 1410 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 ECM22YLR228C 2445 nt3.92□□□□□ -1.78
SEC28P40509 IMH1YLR309C 2736 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YGR117CYGR117C 1431 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YKR015CYKR015C 1707 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 UTP23YOR004W 765 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 SPN1YPR133C 1233 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 PST1YDR055W 1335 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 FLO10YKR102W 3510 nt3.91□□□□□ -1.78
SEC28P40509 FUN12YAL035W 3009 nt3.9□□□□□ -1.78
SEC28P40509 PRP9YDL030W 1593 nt3.9□□□□□ -1.78
SEC28P40509 KIN4YOR233W 2403 nt3.9□□□□□ -1.78
SEC28P40509 REC104YHR157W 549 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YAL069WYAL069W 315 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 NDJ1YOL104C 1059 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 HPA2YPR193C 471 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YBR096WYBR096W 693 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 OAF3YKR064W 2592 nt3.9□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YIG1YPL201C 1386 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 GRX3YDR098C 858 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 IRC22YEL001C 678 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 WBP1YEL002C 1293 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 GEP4YHR100C 558 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YAL004WYAL004W 648 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PET130YJL023C 1044 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 IES3YLR052W 753 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 ASC1YMR116C 960 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PFA4YOL003C 1137 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 CYC2YOR037W 1101 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 HSH49YOR319W 642 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 CUE3YGL110C 1875 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PRM15YMR278W 1869 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 TSR1YDL060W 2367 nt3.89□□□□□ -1.79
SEC28P40509 OKP1YGR179C 1221 nt3.88□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.88□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.88□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YSA1YBR111C 696 nt3.88□□□□□ -1.79
SEC28P40509 CDC14YFR028C 1656 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 VMA1YDL185W 3216 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YDL026WYDL026W 312 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 CTH1YDR151C 978 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 AHA1YDR214W 1053 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 RMD5YDR255C 1266 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 PHM6YDR281C 315 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 FCF1YDR339C 570 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YER034WYER034W 558 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YGR026WYGR026W 837 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 snR17asnR17a 333 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 KTR6YPL053C 1341 nt3.87□□□□□ -1.79
SEC28P40509 SDS23YGL056C 1584 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YDR290WYDR290W 330 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 TRP4YDR354W 1143 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 YGL108CYGL108C 423 nt3.86□□□□□ -1.79
SEC28P40509 COX18YGR062C 951 nt3.86□□□□□ -1.79
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