Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPA3P35244 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPA3P35244 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPA3P35244 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA3P35244 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA3P35244 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA3P35244 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPA3P35244 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA3P35244 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.1 ms