Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00271P0C7V0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00271P0C7V0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms