Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBSP08397 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBSP08397 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBSP08397 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBSP08397 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBSP08397 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBSP08397 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBSP08397 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms