Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM3P06753 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM3P06753 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM3P06753 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM3P06753 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM3P06753 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM3P06753 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM3P06753 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM3P06753 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM3P06753 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms