Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
N4BP1O75113 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
N4BP1O75113 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.5 ms