Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 513.69□□□□□ -0.222e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 313.39□□□□□ -0.272e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.412e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-14■■■■■ 31.7
DKC1O60832 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 31.6
DKC1O60832 ZHX2-202ENST00000534247 873 ntTSL 34.52□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 31.6
DKC1O60832 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 322.58■■□□□ 1.215e-13■■■■■ 31.6
DKC1O60832 AACS-209ENST00000538851 1757 ntTSL 420.57■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 31.5
DKC1O60832 AACS-212ENST00000545511 6646 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 31.5
DKC1O60832 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 31.5
DKC1O60832 AACS-210ENST00000539251 555 ntTSL 412.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 31.5
DKC1O60832 AACS-205ENST00000441247 2536 ntTSL 512.46□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 31.5
DKC1O60832 AACS-202ENST00000316543 3115 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 31.5
DKC1O60832 INPP5A-207ENST00000498337 565 ntTSL 320.07■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 INPP5A-206ENST00000487614 870 ntTSL 519.69■□□□□ 0.747e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.967e-19■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-209ENST00000463948 561 ntTSL 321.02■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.597e-19■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 RPS6KB1-205ENST00000472940 2808 ntTSL 215.34■□□□□ 0.057e-19■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.227e-19■■■■■ 31.5
DKC1O60832 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 31.5
DKC1O60832 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.647e-19■■■■■ 31.5
DKC1O60832 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 31.4
DKC1O60832 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -12e-9■■■■■ 31.4
DKC1O60832 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 31.3
DKC1O60832 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 31.3
DKC1O60832 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 31.3
DKC1O60832 PDE4A-208ENST00000591971 836 ntTSL 513.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 31.3
DKC1O60832 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 31.3
DKC1O60832 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-323■■■■■ 31.2
DKC1O60832 KIAA0907-208ENST00000482337 1135 ntTSL 1 (best)11.02□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 31.2
DKC1O60832 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.981e-323■■■■■ 31.2
DKC1O60832 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.111e-323■■■■■ 31.2
DKC1O60832 OSBPL2-204ENST00000448156 450 ntTSL 310.39□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 31.2
DKC1O60832 OSBPL2-207ENST00000618198 693 ntTSL 29.85□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 232.95■■■□□ 2.872e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 232.95■■■□□ 2.872e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 429.38■■■□□ 2.292e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 529.27■■■□□ 2.282e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.732e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 221.6■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 220.93■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 519.86■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 415□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 31.2
DKC1O60832 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.553e-6■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 328.53■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.853e-6■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.213e-6■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.28e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.84■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)21.84■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.758e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.97■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 518.88■□□□□ 0.618e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 418■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 314.03□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.68e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.448e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.238e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.228e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.088e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.968e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 413.6□□□□□ -0.232e-24■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 512.68□□□□□ -0.388e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 TNS1-206ENST00000423413 548 ntTSL 312.49□□□□□ -0.418e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.464e-11■■■■■ 31.1
DKC1O60832 TNS1-203ENST00000413280 667 ntTSL 410.6□□□□□ -0.718e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 310.53□□□□□ -0.728e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)10.06□□□□□ -0.88e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-211ENST00000559605 379 ntTSL 39.68□□□□□ -0.868e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PVT1-210ENST00000521122 221 ntTSL 39.38□□□□□ -0.918e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.928e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 PCSK6-213ENST00000560902 501 ntTSL 48.64□□□□□ -1.038e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 TNS1-211ENST00000449814 582 ntTSL 37.24□□□□□ -1.258e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 NLK-202ENST00000496808 1702 ntTSL 25.8□□□□□ -1.488e-13■■■■■ 31.1
DKC1O60832 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.684e-11■■■■■ 31.1
DKC1O60832 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 54.44□□□□□ -1.74e-11■■■■■ 31.1
DKC1O60832 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 31.1
DKC1O60832 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.411e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.061e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.921e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-323■■■■■ 30.9
DKC1O60832 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.41e-323■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 8,567 protein–RNA pairs in 156.1 ms