Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ODF3BA8MYP8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ODF3BA8MYP8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms