Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN11AQ9UI33 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN11AQ9UI33 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms