Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMIM3Q9BZL3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms