Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PACSIN1Q9BY11 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PACSIN1Q9BY11 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms