Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C1QTNF1Q9BXJ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms