Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP25Q9BV90 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms