Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPRD1AQ96P16 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPRD1AQ96P16 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms