Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC34Q96HJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms