Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD5

PHF21A, PHD finger protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21AQ96BD5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF21AQ96BD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF21AQ96BD5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms