Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC62Q6P9F0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC62Q6P9F0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC62Q6P9F0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms