Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXT1Q16394 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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EXT1Q16394 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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EXT1Q16394 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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EXT1Q16394 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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EXT1Q16394 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EXT1Q16394 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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