Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NID2Q14112 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NID2Q14112 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NID2Q14112 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NID2Q14112 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NID2Q14112 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NID2Q14112 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NID2Q14112 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NID2Q14112 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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