Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDH18Q13634 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDH18Q13634 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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