Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALCOCO2Q13137 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO2Q13137 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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