Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAF3Q13114 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TRAF3Q13114 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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TRAF3Q13114 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAF3Q13114 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
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