Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC63Q05C16 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms