Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IP78347 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms